Manny, Diego und Sid staunen nicht schlecht, als ihr Kontinent vom Festland abbricht und führungslos über die Weltmeere treibt. Sie retten sich auf einen Eisberg, den sie als Schiff nutzen und steuern einer ungewissen Zukunft entgegen. Unterwegs gilt es einige Abenteuer zu bestehen: Sie treffen auf unbekannte Meereswesen und müssen auf dem Weg in eine neue Welt den Kampf gegen Piraten gewinnen.

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